COMPRENDRE LE MICROBIOTE
Véritable écosystème vivant, le microbiote intestinal joue un rôle central dans l’assimilation des nutriments et le bon fonctionnement du système immunitaire. Sa richesse et son équilibre sont étroitement liés à notre bien-être global. Dans cette page, nous vous invitons à explorer en profondeur le monde fascinant du microbiote : comprendre son fonctionnement, les facteurs qui influencent son équilibre, et pourquoi il est essentiel d’en prendre soin au quotidien.
Qu'est-ce que le microbiote ?
Le microbiote humain englobe une variété de micro-organismes tels que des bactéries, des virus, des champignons, et d'autres petits organismes qui se trouvent à l'intérieur et à l'extérieur du corps humain.
En réalité, il n’existe pas un mais plusieurs microbiotes comme le microbiote cutané, celui de la peau, le microbiote vaginal (ou flore vaginale), le microbiote intestinal (ou flore intestinale), celui de notre tube digestif.
Le microbiote intestinal est le microbiote le plus riche du corps humain.
Celui-ci se forme très rapidement après la naissance et se compose de 100 000 milliards de bactéries et levures issues de centaines d'espèces différentes.
Ces micro-organismes vivent en symbiose avec nous : ils se nourrissent de nos aliments et en contrepartie, nous apportent de nombreux bienfaits au quotidien.
30% de notre microbiote intestinal serait commun à la majorité d’entre nous, mais la composition de chaque microbiote intestinal reste unique.
Le microbiote intestinal assure plusieurs fonctions :
- Une fonction nutritionnelle : le microbiote intestinal contribue à l'assimilation des nutriments.
- Une fonction digestive : il garantit le bon fonctionnement physiologique de l'intestin.
- Une fonction protectrice : le microbiote intestinal renforce et stimule nos défenses naturelles.
Comment Évolue le microbiote au cours de la vie ?
Tout au long de notre vie, notre microbiote évolue.
Nos modes de vie ont aussi une incidence sur la richesse et le bon fonctionnement de notre flore intestinale. Une alimentation basée sur des produits transformés ou trop sucrés, pauvres en fibres, peut perturber sur le long terme notre microbiote intestinal.
D’autres facteurs comme la prise d’antibiotiques de façon répétée, le stress ou certaines maladies peuvent entraîner une baisse considérable du nombre de bactéries dans les flores vaginales et/ou intestinales.
En supplément d’une alimentation variée, équilibrée et riche en fibres, les probiotiques jouent un rôle clé pour maintenir notre microbiote en bonne santé.
Pourquoi consommer des probiotiques ?
Les probiotiques sont généralement des bactéries bénéfiques ou des levures qui sont similaires aux micro-organismes naturellement présents dans le système digestif humain. Ils sont souvent appelés "bonnes bactéries" car ils contribuent à maintenir un équilibre sain de la flore intestinale.
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Avant de déployer leurs effets bénéfiques, les probiotiques entreprennent un voyage complexe : ils sont ingérés par voie orale, puis doivent résister à l'acidité des sucs gastriques et à l'action des enzymes digestives. Ils poursuivent leur parcours à travers l'intestin grêle, un trajet qui dure généralement de 4 à 6 heures, pour finalement atteindre la partie terminale du tube digestif, le côlon.
Au cours de ce périple, de nombreuses bactéries probiotiques peuvent être désactivées. Une fois dans le côlon, les probiotiques s'intègrent à la flore intestinale, trouvent les nutriments nécessaires à leur survie, se multiplient et... commencent à exercer leurs bienfaits !
Bien choisir ses probiotiques
Face à la multitude de références disponibles sur le marché, choisir un probiotique peut sembler complexe. Souches, ferments lactiques, nombre d’Unités Formant Colonies (UFC) : autant de données techniques qui peuvent dérouter. Pour faire un choix éclairé, mieux vaut comprendre la signification et l’intérêt de ces critères.
Nombre de souches et diversité du microbiote
Un probiotique peut contenir une ou plusieurs souches bactériennes. Opter pour une formule multi-souches présente un intérêt particulier : chaque souche possède des propriétés spécifiques, et leur synergie permet de soutenir une plus grande diversité du microbiote intestinal. Cette diversité est un indicateur important d’un microbiote en bonne santé, selon plusieurs études (Lloyd-Price et al., 2016 ; Human Microbiome Project).
Quantité de ferments : des milliards, mais pas n'importe lesquels
Le nombre de ferments lactiques s’exprime en milliards d’UFC (unités formant colonies). Contrairement à une idée reçue, un nombre élevé ne garantit pas forcément une meilleure efficacité. L’efficacité dépend surtout de la viabilité des souches, de leur capacité à survivre au passage gastro-intestinal et à coloniser temporairement l’intestin. Dans certains cas (après une prise d’antibiotiques, en voyage, ou en période de déséquilibre), une dose plus élevée peut être pertinente sur une courte période.
Des souches bien documentées et adaptées aux besoins
Il est recommandé de privilégier les produits qui mentionnent précisément les souches utilisées (par exemple : Lactospore Bacillus coagulans), idéalement soutenues par des études cliniques. Certaines souches sont mieux documentées pour des indications spécifiques (troubles digestifs, immunité, flore intime, etc.).
Conservation, enrobage, synergie avec les prébiotiques
Outre les souches et leur concentration, d’autres critères peuvent faire la différence : la forme galénique (gélule gastrorésistante, sachet, etc.), la présence de prébiotiques (fibres favorisant l’implantation des probiotiques) ou encore les conditions de conservation (réfrigéré ou non).
En résumé
Le choix d’un probiotique ne doit pas reposer sur un seul critère, mais sur l’ensemble des caractéristiques du produit, en lien avec votre besoin spécifique. N’hésitez pas à demander conseil à un professionnel de santé ou à consulter les études associées aux souches indiquées sur l’étiquette.
Prébiotique, probiotique, postbiotique et synbiotique : quelles différences ?
Peut-être vous êtes-vous déjà demandé à quoi correspondent ces mots et ce qui les différencie.
Nous l’avons vu, les probiotiques (parfois aussi appelés microbiotiques) sont des micro-organismes vivants qui lorsqu’ils sont administrés en quantité suffisante, peuvent avoir des effets positifs sur notre santé, en contribuant à l’équilibre de la flore intestinale. Considérés comme des « bonnes bactéries », on les trouve dans les aliments fermentés ou dans les compléments alimentaires.
Les prébiotiques sont en quelque sorte les aliments qui nourrissent ces probiotiques. Notre flore intestinale a besoin d’un apport de fibres végétale pour être diversifiée et assurer son rôle de façon optimale. On les trouve par exemple dans les fruits et légumes (fibres solubles) et dans les céréales (fibres insolubles). On parle de fibres prébiotiques, car elles servent de substrat pour la croissance de la flore intestinale.
Les postbiotiques peuvent aussi avoir des effets bénéfiques sur la santé. Il s’agit de micro-organismes inanimés intacts et ou de leurs fragments de cellules microbiennes (paroi cellulaire, membranes…). Les postbiotiques apportent un ensemble de molécules actives telles que des acides organiques (comme l’acide lactique), des fragments de paroi bactérienne, des peptides, des exopolysaccharides ou encore des vitamines du groupe B. Ces composés peuvent contribuer au renforcement de la barrière intestinale, à la modulation immunitaire et à l’équilibre du microbiote.
Enfin, on parle de synbiotique lorsqu’un complément alimentaire propose une formule réunissant probiotique et prébiotique. L’intérêt est ici est de maximiser la synergie entre les probiotiques et les prébiotiques pour favoriser une flore intestinale saine.
Nos réferences
Inserm. Microbiote intestinal (flore intestinale). Consulté le 28 juillet 2025, depuis : https://www.inserm.fr/dossier/microbiote-intestinal-flore-intestinale/
CNRS Le journal. Microbiote : des bactéries qui nous veulent du bien. Consulté le 28 juillet 2025, depuis : https://lejournal.cnrs.fr/articles/microbiote-des-bacteries-qui-nous-veulent-du-bien
Le French Gut. Deviens incollable sur le microbiote. Document PDF consulté le 28 juillet 2025, depuis : https://lefrenchgut.fr/wp-content/uploads/2023/04/INCOLLABLES-HD.pdf